歐洲的毛犀牛基因從捕食者糞便中的DNA重建

我們可能忽略了一個令人驚訝的豐富的古代DNA來源。

科學家們已經設法重建了已滅絕的毛犀牛的線粒體基因組（Coelodonta antiquitatis 古齒獸） – 從洞穴鬣狗的糞便化石中提取的 DNA （Crocuta crocuta spelea）在上面吃飯。

這是歐洲第一個發現毛犀牛的基因組;該物種之前的所有基因組數據都來自西伯利亞動物。這也許可以為我們提供一些關于犀牛群之間區域差異的線索——但它也表明糞便化石，或共云母，可能是一種寶貴的資源。

“這里產生的有絲分裂基因組組裝是歐洲毛犀牛的第一個有絲分裂基因組記錄，因此是幫助解決這一標志性更新世巨型動物物種系統地理學的重要資源，”研究人員在他們的論文中寫道.

“事實上，這些都是從另一個物種的coprolite中相對容易地檢索到的（即不需要與毛犀牛直接相關的遺骸），這強調了從各種材料中獲取基因組數據的價值。

實際上，coprolites被證明是一座歷史悠久的金礦。從保存的糞便中，我們可以計算出什么人和動物吃了在過去，仔細研究他們感染的寄生蟲，甚至學習人體腸道微生物組的變化.

由德國康斯坦茨大學的分子生物學家彼得·安德烈亞斯·西伯（Peter Andreas Seeber）領導的一個團隊研究了兩種鬣狗糞便化石。舊石器時代中期在現在的德國，這一時期大約在 300,000 到 30,000 年前。

這些共生巖已被挖掘出來并坐在博物館藏品如現在許多共生巖都這樣做了.去年發表的一篇論文斷言博物館藏品中的共生巖是研究地球生物歷史時被忽視和未充分利用的資源。

Seeber和他的同事們使用一種特殊的工具從共生巖內部提取材料，準備DNA進行讀取，并通過DNA測序儀運行結果。

DNA被降解;但研究人員設法從洞穴鬣狗和毛犀牛中恢復了遺傳物質，并將它們與其他現代和古代基因組進行了比較。

而且，盡管犀牛的DNA僅從單個樣本中獲得，但它能夠告訴研究人員有關該物種及其在歐亞大陸上的多樣性的新信息。

事實上，最終成為鬣狗的歐洲犀牛和西伯利亞犀牛之間存在足夠的差異，這表明這兩個群體在很久以前就開始多樣化。歐洲犀牛在 250 萬到 150,000 年前的某個時候開始分裂。

這與犀牛在更新世晚期反復向西歐擴張的假設直接矛盾，至少對于這頭犀牛所屬的崩潰而言是這樣。

進一步恢復和分析這些古老、雄偉的犀牛的DNA，將有助于揭示更多關于它們的歷史，即使我們必須從像糞便這樣絕對不雄偉的東西中恢復它。

“和這些樣本一樣，”研究人員寫道，“在過去的發掘中發現并存在于收藏品中的許多考古物品，迄今為止在很大程度上被忽視了古代DNA的來源。

該研究已發表在生物學快報.

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